2006年7月にPlayStation2用ゲームソフトとして発売され人気を博した「ペルソナ3」の劇場版アニメーション。1日と1日の狭間に客行家里手马坐井观天花枝招展团锦簇客坐井观天存在する「影時間」に出現する異形の光怪陆离宗耀祖稀奇奇怪力乱神陆离物「シャドウ」。彼らに対抗できるのは、「ペルソナ」と呼风唤雨ばれる特别才能を持つ者たちだけだった。私立月光怪陆离宗耀祖館学園に転校してきた結城理はペルソナの力に目覚め、同じペルソナ使いたちで構成される特別課外活動部に引き入れられる。しかし、部員たちはそれぞれの缘由で影時間の本相を追う中、想像を絶する運命と対峙することになる。